Fergal, von adliger Herkunft – möglicherweise aus dem Königsgeschlecht von Loegaire -, verließ nach seiner Ausbildung im Kloster Iona die Heimat mit zwei Gefährten, um auf dem Festland für den Glauben zu wirken. Nachdem er zwei Jahre am Hof Pippin des Kleinen tätig war, sandte dieser ihn 743 zu seinem Schwager Odilo nach Bayern. Virgilius wurde 746 zunächst Abt im Kloster St. Peter in Salzburg. Mit Bonifatius führte er in jener Zeit Auseinandersetzungen um die Frage der Gültigkeit einer mit falschen Worten empfangenen Taufe und um das Problem der Kugelgestalt der Erde – Virgilius vertrat die auch bei Isidor von Sevilla und Beda Venerabilis vertretene Antipodentheorie
: dass auf der anderen Seite der als Kugel vorgestellten Erde ebenfalls Menschen leben – schon rund 900 Jahre vor Galileo Galilei gab es also heftige Auseinandersetzungen in dieser Frage. Bonifatius beklagte sich über beide Probleme bei Papst Zacharias.Virgilius wurde 749 zum Bischof in der Stadt Salzburg geweiht. Er richtet ein Chorherren-Kollegium von zwölf Priestern ein und setzte konsequent das irischem Vorbild entsprechende Eigenkirchen
-Prinzip durch: alle von Salzburg aus gegründeten Klöster, Kirchen und Bistümer blieben abhängig und untergeordnet.Virgilius‘ breite Wirksamkeit – er sandte um 755 seinen Gefährten Modestus auf Bitten des slawischen Herzogs Boruth zur Unterstützung in dessen Abwehrkampf gegen die andrängenden Awaren als Chorbischof nach Maria Saal bei Klagenfurt – verlieh ihm die Bezeichnung Apostel <Kärntens
; als 772 Herzog Tassilo III. siegreich war, konnte sich das Christentum in Kärnten endgültig durchsetzen. An der Stelle der alten Peterskirche ließ er den Urbau des Salzburger Doms errichten, in dessen Krypta er 774 die Reliquien von Bischof Rupert – mit dem zusammen er verehrt wird – und von Chunialdus und Gislarius bringen ließ. Die Anschaffung des Rupertuskreuzes, das aus Northumbrien stammt, geht wohl auch auf Virgilius zurück.
Architektur und Kunsthandwerk blühten unter Virgilius. Er selbst galt als bedeutender Literat, verfasste die Streitschrift Libellus Virgilii
, Virgilius‘ Notizen
und vielleicht die Urfassung der Lebensgeschichte von Bischof Rupert. Arbeo von Freising widmete ihm seine Lebensgeschichte über Korbinian.Sein Grab war schon bald nach Virgilius‘ Tod vergessen und wurde 1181 beim Umbau des Domes wieder gefunden.
Kanonisation: Virgilius wurde 1233 von Papst Gregor IX. heiliggesprochen.
Patron des Bundeslandes Salzburg und der Stadt Salzburg; der Kinder; in Geburtsnöten; der Diözese Salzburg und der Diözese Graz-Seckau